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Anti-ATF6 antibody - Aminoterminal end (ab65838)

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1 question for ab65838

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Question 1

Wednesday 09-November-2011

Vielen Dank für Ihre ausführlich Mail und die vielen Hinweise. Hinsichtlich des ORP150 wären wir sehr an dem Blocking Peptid interessiert. Wäre es in diesem Fall möglich, dass Sie uns dieses kostenfrei zukommen ließen, damit wir diesen sehr wichtigen Antikörper in unserem Labor für humane Proben etablieren könnten? Ihre Anmerkungen bezüglich des ATF6 gesamt - und des aminoterminalen Antikörper habe ich mit großem Interesse gelesen und werde mit diesen weiter an der Etablierung des Antikörper arbeiten, allerdings stellt sich mir die Frage, warum im Datenblatt von Abcam für den ab65838 folgendes steht: "Predicted molecular weight: 75 kDa" Ich gehe davon aus, dass ungeschnittenes ATF6 ein Molekulargewicht von 90 kDa aufweist, siehe auch ab11909, und das beim Schneiden ein Fragment mit 50 kDa und eines mit 40 kDa entsteht - wo tauchen dann aber die 75 kDa auf?

ANSWER:

 

Vielen Dank für Ihre Antwort und für diese weiteren Informationen. 

Bitte entschuldigen Sie die Verzögerung. Ich habe nun eine kostenfreie Lieferung des Blockpeptides für ORP150 arrangiert. Sie hat die Referenznummer xxxxx und sollte in den nächsten Tagen bei Ihnen ankommen. 

Die Angabe des erwarteten Molekulargewichts bezieht sich ausschließlich auf den Proteinanteil von ATF6. Unter der SwissProt-Identifikation P18850 (http://www.uniprot.org/uniprot/P18850 ) wird diese mit 75 kDa angegeben; die Schnittstelle befindet sich bei Aminosäure 419/420, also nach etwa 2/3, so dass ein ca 50 kDa und ein ca 25 kDa Fragment entstehen. Allerdings ist zu beachten, dass ATF6 recht stark glykosyliert sein kann, was die Laufeigenschaften des Proteins in einem Gel beeinflussen kann. Dadurch ließe sich auch erklären, dass ab11909 eine Bande von über 90 kDa für das ungeschnittene Fragment detektiert. Das 36 kDa-Fragment wurde leider nicht charakterisiert; es kann sich jedoch um ein ATF6-Abbaufragment handeln (z.B. das kleinere 25 kDa-Fragment plus Glykosylierung).

Für diese nicht ganz eindeutigen Angaben möchte ich mich bei Ihnen entschuldigen. Bei den Angaben auf unseren Datenblättern sind wir leider auf die Angaben und Abbildungen angewiesen, die uns das herstellende Labor zur Verfügung stellt. Daher haben wir nicht immer alle nötigen Informationen zu den detektierten Banden bzw. den Bedingungen, unter denen die Zellen kultiviert/behandelt wurden.

Ich hoffe dennoch, dass diese Informationen Ihnen weiterhelfen. Bitte zögern Sie nicht, sich wieder bei uns zu melden, falls Sie weitere Fragen haben.

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